Now documents the function calls.
[dagnn.git] / dagnn.lua
1
2 --[[
3
4    Copyright (c) 2016 Idiap Research Institute, http://www.idiap.ch/
5    Written by Francois Fleuret <francois.fleuret@idiap.ch>
6
7    This file is free software: you can redistribute it and/or modify
8    it under the terms of the GNU General Public License version 3 as
9    published by the Free Software Foundation.
10
11    It is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
12    ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
13    or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public
14    License for more details.
15
16    You should have received a copy of the GNU General Public License
17    along with this file.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18
19 ]]--
20
21 require 'torch'
22 require 'nn'
23
24 local DAG, parent = torch.class('nn.DAG', 'nn.Container')
25
26 function DAG:__init()
27    parent.__init(self)
28    -- Nodes are indexed by the module they contain
29    self.node = { }
30 end
31
32 -- Apply f on t recursively; use the corresponding elements from args
33 -- (i.e. same keys) as second parameter to f when available; return
34 -- the results from f, organized in a similarly nested table.
35 function DAG:nestedApply(f, t, args)
36    if torch.type(t) == 'table' then
37       local result = {}
38       for k, s in pairs(t) do
39          result[k] = self:nestedApply(f, s, args and args[k])
40       end
41       return result
42    else
43       return f(t, args)
44    end
45 end
46
47 function DAG:createNode(nnm)
48    if not self.node[nnm] then
49       self:add(nnm) -- Add it to the object as a Container
50       local node = {}
51       node.succ = {}
52       node.pred = {}
53       node.index = #self.modules
54       self.node[nnm] = node
55    end
56 end
57
58 function DAG:putInOrder()
59    if self.sorted then
60       return
61    end
62
63    local distance = {}
64    self:nestedApply(function(m) distance[m] = 1 end, self.inputModules)
65
66    local nc
67    repeat
68       nc = 0
69       for nnma, node in pairs(self.node) do
70          for _, nnmb in pairs(node.succ) do
71             if distance[nnma] and (not distance[nnmb] or distance[nnmb] < distance[nnma] + 1) then
72                distance[nnmb] = distance[nnma] + 1
73                nc = nc + 1
74             end
75          end
76       end
77    until nc == 0
78
79    self.sorted = { }
80    for m, d in pairs(distance) do
81       table.insert(self.sorted, { distance = d, nnm = m })
82    end
83
84    table.sort(self.sorted, function(a, b) return a.distance < b.distance end)
85
86    for i, a in ipairs(self.sorted) do self.sorted[i] = a.nnm end
87 end
88
89 function DAG:computeGradOutput(gradInputSucc)
90    local gi
91    if #gradInputSucc == 1 then
92       gi = gradInputSucc[1] -- we avoid a clone()
93    elseif #gradInputSucc > 1 then
94       for k = 1, #gradInputSucc do
95          if gi then
96             gi:add(gradInputSucc[k])
97          else
98             gi = gradInputSucc[k]:clone()
99          end
100       end
101    end
102    return gi
103 end
104
105 ----------------------------------------------------------------------
106
107 -- Connect a sequence of modules
108 function DAG:connect(...)
109    self.sorted = nil
110    local prev
111    for _, nnm in pairs({...}) do
112       self:createNode(nnm)
113       if prev then
114          table.insert(self.node[nnm].pred, prev)
115          table.insert(self.node[prev].succ, nnm)
116       end
117       prev = nnm
118    end
119 end
120
121 function DAG:setInput(i)
122    self.sorted = nil
123    self.inputModules = i
124    self:nestedApply(
125       function(nnm)
126          if #self.node[nnm].succ == 0 then
127             error('Input modules must have outgoing  edges.')
128          end
129          if #self.node[nnm].pred > 0 then
130             error('Input modules cannog have incoming edges.')
131          end
132       end,
133       self.inputModules
134    )
135 end
136
137 function DAG:setOutput(o)
138    self.sorted = nil
139    self.outputModules = o
140    self:nestedApply(
141       function(nnm)
142          if #self.node[nnm].pred == 0 then
143             error('Output module must have incoming edges.')
144          end
145          if #self.node[nnm].succ > 0 then
146             error('Output module cannot have outgoing edges.')
147          end
148       end,
149       self.outputModules
150    )
151 end
152
153 function DAG:print()
154    self:putInOrder()
155
156    for i, d in ipairs(self.sorted) do
157       print('#' .. i .. ' -> ' .. torch.type(d))
158    end
159 end
160
161 ----------------------------------------------------------------------
162
163 function DAG:saveDot(filename)
164    local file = (filename and io.open(filename, 'w')) or io.stdout
165
166    file:write('digraph {\n')
167
168    file:write('\n')
169
170    for nnma, node in pairs(self.node) do
171       file:write(
172          '  '
173             .. node.index
174             .. ' [shape=box,label=\"' .. torch.type(nnma) .. '\"]'
175             .. '\n'
176       )
177
178       for _, nnmb in pairs(node.succ) do
179          file:write(
180             '  '
181                .. node.index
182                .. ' -> '
183                .. self.node[nnmb].index
184                .. '\n'
185          )
186       end
187
188       file:write('\n')
189    end
190
191    file:write('}\n')
192
193 end
194
195 ----------------------------------------------------------------------
196
197 function DAG:updateOutput(input)
198    self:putInOrder()
199
200    self:nestedApply(
201       function(nnm, i)
202          self.node[nnm].input = i
203          -- nnm:updateOutput(i)
204          self:rethrowErrors(nnm, self.node[nnm].index, 'updateOutput', i)
205       end,
206       self.inputModules,
207       input
208    )
209
210    for _, nnm in ipairs(self.sorted) do
211       local node = self.node[nnm]
212       if #node.pred > 0 then
213          local i
214          if #node.pred == 1 then
215             i = node.pred[1].output
216          elseif #node.pred > 1 then
217             i = {}
218             for k = 1, #node.pred do
219                i[k] = node.pred[k].output
220             end
221          end
222          node.input = i
223          -- nnm:updateOutput(i)
224          self:rethrowErrors(nnm, self.node[nnm].index, 'updateOutput', i)
225       end
226    end
227
228    self.output = self:nestedApply(
229       function(m) return m.output end,
230       self.outputModules
231    )
232
233    return self.output
234 end
235
236 function DAG:updateGradInput(input, gradOutput)
237    assert(self.sorted, 'there has been a DAG structure change before a DAG:updateGradInput')
238
239    self:nestedApply(
240       function(nnm, go)
241          -- nnm:updateGradInput(self.node[nnm].input, go)
242          self:rethrowErrors(nnm, self.node[nnm].index, 'updateGradInput', self.node[nnm].input, go)
243       end,
244       self.outputModules, gradOutput
245    )
246
247    self:nestedApply(
248       function(nnm, i) self.node[nnm].input = i end,
249       self.inputModules, input
250    )
251
252    for _, node in pairs(self.node) do
253       node.gradInputSucc = {}
254    end
255
256    for k = #self.sorted, 1, -1 do
257       local nnm = self.sorted[k]
258       local node = self.node[nnm]
259       local pred, gradInputSucc = node.pred, node.gradInputSucc
260
261       if #gradInputSucc > 0 then
262          node.gradOutput = self:computeGradOutput(gradInputSucc)
263          -- nnm:updateGradInput(node.input, node.gradOutput)
264          self:rethrowErrors(nnm, self.node[nnm].index, 'updateGradInput', node.input, node.gradOutput)
265       end
266
267       -- We fill the gradInputSucc of our predecessors
268       if #pred == 1 then
269          table.insert(self.node[pred[1]].gradInputSucc, nnm.gradInput)
270       elseif #pred > 1 then
271          if not torch.type(nnm.gradInput) == 'table' then
272             error('Should have a table gradInput since it has multiple predecessors')
273          end
274          for n = 1, #pred do
275             table.insert(self.node[node.pred[n]].gradInputSucc, nnm.gradInput[n])
276          end
277       end
278    end
279
280    self.gradInput = self:nestedApply(function(m) return m.gradInput end, self.inputModules)
281
282    return self.gradInput
283 end
284
285 function DAG:accGradParameters(input, gradOutput, scale)
286    scale = scale or 1
287
288    assert(self.sorted, 'there has been a DAG structure change before a DAG:accGradParameters')
289
290    for k = 1, #self.modules do
291       local nnm = self.modules[k]
292       local node = self.node[nnm]
293       -- nnm:accGradParameters(node.input, node.gradOutput, scale)
294       self:rethrowErrors(nnm, k, 'accGradParameters', node.input, self:computeGradOutput(node.gradInputSucc), scale)
295    end
296 end